Patrick Fournillier ist regelmäßig an den großen Opernhäusern Frankreichs, Italiens und Spaniens zu Gast. Auch am Grand Théâtre de Génève, Opernhaus Zürich, Nationaltheater Zagreb, Welsh National Opera, Montreal Opera und Seattle Opera trat er bisher auf. Ihn verbindet eine enge Zusammenarbeit mit dem Orchestre de la Radio Suisse Romande, dem Tschechischen Philharmonischen Orchester, der Prager Philharmonie, dem BBC Symphony Orchestra, dem Europe Chamber Orchestra und dem English Chamber Orchestra, mit denen er bisher zahlreiche symphonische Konzerte in Europa, Ägypten und den USA gab. Im Bereich Oper leitete er »Don Quichotte« und »Carmen« am Teatro Regio in Turin, »Werther« an der Vlaamse Opera Flandern, »Lucia di Lammermoor«, »Semiramide« und »Carmen« an der Deutschen Oper Berlin, »Faust« beim Ravenna Festival, »Les dialogues des Carmélites« und »Carmen« in Oslo, »I Pagliacci« und »Cavalleria rusticana« in Seattle, »Aida« in Amsterdam, »La sonnambula« in der Arena di Verona, »Manon Lescaut« an der Berliner Staatsoper Unter den Linden, »Faust« in Zürich, »La damnation de Faust« an der Semperoper sowie »Werther« an der Bayerischen Staatsoper. 2010 debütierte er an der Metropolitan Opera in New York mit »Les contes d’Hoffmann« und an der San Francisco Opera mit »Cyrano de Bergerac«. Weitere Engagements sind »Carmen« in Zürich, »Hamlet« an der Opéra du Rhin in Straßburg, »Thaïs« in Valencia, »Les pêcheurs de perles« in Zürich und San Francisco, »Manon Lescaut« in Warschau und »Suor Angelica« in Seattle. An der Semperoper übernimmt er 2012/13 die musikalische Leitung der Dresdner Operngala »À la française«.