Geboren in Düsseldorf, studierte Markus Marquardt an der Hochschule für Musik seiner Heimatstadt. Nach einem Engagement in Stuttgart wurde der Bass-Bariton im Jahr 2000 Ensemblemitglied der Semperoper Dresden, wo er 2004 mit dem Christel-Goltz-Preis der Stiftung zur Förderung der Semperoper geehrt wurde. Gastspiele führten ihn u.a. nach Amsterdam, zu den Salzburger und Bregenzer Festspielen, an die Staatsopern in Hamburg, München und Wien, an die Deutsche Oper Berlin, die Deutsche Oper am Rhein, die Oper Leipzig, die Oper Stuttgart, nach Genf, Lyon, Neapel, Tokio und an das Teatro alla Scala di Milano. An der Semperoper sang er bisher u.a. die Partien Cardillac, Rigoletto, Macbeth, Figaro (»Le nozze di Figaro«), Leporello (»Don Giovanni«), Jochanaan (»Salome«), Frank Maurrant (»Street Scene«), Dr. Schön/Jack the Ripper (»Lulu«), Sharpless (»Madama Butterfly«), Vater (»Hänsel und Gretel«), Colline (»La bohème«), Giorgio Germont (»La traviata«), Paolo Albiani (»Simon Boccanegra«), Holländer (»Der fliegende Holländer«), Orest (»Elektra«), Baron Scarpia (»Tosca«) und Wotan (»Die Walküre«). In der Dresdner Neuinszenierung »Mathis der Maler« übernahm Markus Marquardt in der Saison 2015/16 die Titelpartie. Darüber hinaus ist Markus Marquardt auch auf dem Konzertpodium gefragt. Zu seinen Engagements gehörten u.a. Jaroslav Prus (»Věc Makropulos«) an der Wiener Staatsoper, Wotan (»Die Walküre«) an der Oper Leipzig und Rigoletto und Jochanaan in Stuttgart. 2017 sang er u.a. Baron Scarpia an der Canadian Opera Company in Toronto sowie Nabucco in Stuttgart. An der Semperoper steht er in der Spielzeit 2017/18 u.a. als Jago (»Otello«), Jochanaan, Rigoletto, Sprecher (»Die Zauberflöte«), Vater (»Hänsel und Gretel«) und Kreon in der Neuproduktion »Oedipus Rex« auf der Bühne.