Der gebürtige Österreicher absolvierte seine musikalische Ausbildung an der Hochschule für Musik in Wien. Seine Erfahrungen als langjähriges Mitglied der Wiener Philharmoniker prägen bis heute seine Arbeit als Dirigent. Nach Assistenzen bei Claudio Abbado in Wien und Stationen in Zürich, Oslo und Leipzig erhielt Honeck seine erste Chefposition im Jahr 2000 an der Spitze des Swedish Radio Symphony Orchestra. Seit der Spielzeit 2008/2009 ist er Music Director des Pittsburgh Symphony Orchestra und steht damit in der Nachfolge von Lorin Maazel und Mariss Jansons. Mittlerweile gastiert er regelmäßig bei den führenden internationalen Klangkörpern, so den Wiener Philharmonikern, dem Gewandhausorchester Leipzig sowie dem Concertgebouworkest Amsterdam. Sein Debüt am Pult der Staatskapelle gab er anlässlich eines Silvesterkonzertes im Jahr 1995.