Der gebürtige Niedersachse studierte an der Hamburg School of Entertainment und schloss die Joop van den Enden Academy als Musicaldarsteller 2010 ab. Bereits während seiner Ausbildung war er im Ensemble von Tosca – Das Rock-Musical im Operettenhaus in Hamburg und als Billy in Kehrwieder 201.0 FM – Die Radioshow im Theater Kehrwieder in Hamburg zu erleben. Christopher Wernecke war Gesangssolist im Musical Tanz der Vampire sowohl im Palladium Theater Stuttgart, als auch im Theater des Westens Berlin. Als Doody in Grease ging er auf großer Europatournee. Er war im Ensemble der Deutschlandpremiere von Die schwarzen Brüder auf Schloss Bückeburg und stand in der Staatsoperette Dresden 2015 bis 2017 als Agent Dollar in der Produktion Catch me if you can auf der Bühne. Das Theater am Potsdamer Platz engagierte ihn anschließend als Swing und Cover für einige Hauptrollen im Berlin-Musical Hinterm Horizont. Mit Ulf Dietrichs Inszenierung von Sweet Charity war er auf Gastspiel in Südkorea und ging danach mit Dietrichs Inszenierung von Evita auf Tournee durch Europa. Er war 2016 und 2017 als Skimbleshanks in Cats bei den Luisenburg-Festspielen in Wunsiedel. Im Boulevardtheater Dresden gab er 2017 Felix in Die Tortenkiller und spielte Cabaret im Alten Schauspielhaus in Stuttgart. In Cabaret ist Christopher Wernecke auch in der Semperoper Dresden zu erleben.